POY

Beskrivelse

POY er et fylogenetisk analyseprogram, der understøtter flere slags data (f.eks. morfologi, nukleotider, gener og genregioner, kromosomer og hele genomer). POY er særlig ved, at den kan udføre ægte alignment og fylogeni-inferens, dvs. inputsekvenser behøver ikke at være forudjusteret. Indsættelser, sletninger og omarrangeringer kan derefter inkluderes i den samlede træscore under Maximum Parsimony eller i modellen under Maximum Likelihood. En række heuristiske algoritmer er blevet udviklet til dette formål og er implementeret i POY.