Malign

Beskrivelse

De multiple tilpasningsprocedurer implementeret i MALIGN er tætte paralleller til dem, der bruges til at søge efter kladogrammer med mindste længde. Logikken og programkommandoerne vil være klare for dem, der er fortrolige med programmer som Hennig86, NONA og PAUP. Justeringstopologier er konstrueret via forskellige sekvenser og forbedret gennem grenbytning. Hver justeringstopologi giver en multipel justering, og kladogrammer er konstrueret ud fra denne justering. Omkostningerne ved det mest sparsommelige kladogram tildeles derefter som de multiple tilpasningsomkostninger.