MacMolPlt for Mac

Beskrivelse

MacMolPlt er et kemivisualiseringsværktøj, der kan bruges til at bygge molekyler med en integreret grafisk modelbygger, oprette inputfiler til GAMESS computerkemiprogrammet og derefter visualisere resultaterne af computerkemikørsel. Funktionerne omfatter en højkvalitets 3D-skærm, animationer af normale tilstande og reaktionssekvenser og output til en række forskellige formater, herunder billeder i høj kvalitet og QuickTime- og Flash-film.

Input ved hjælp af: MolPlt-filformat udstanset af GAMESS ved at indsætte kartesiske koordinater fra enhver GAMESS- eller Gauss-logfil enhver GAMESS-input-, log- eller irc-fil Xmol-stil XYZ-fil MolDen-formatfiler Protein Data Bank (pdb) fil Chemical Markup Language (CML) filer Byg grafisk med en interaktiv molekyle editor Byg i hånden ved hjælp af kartesiske eller Z-Matrix stil interne koordinater 3D visning af struktur og normal tilstand Animation af normale tilstande. 3D-realtidsrotation og -translation under musestyring Beregning af enhver Z-matrix-parameter Mål/vis visuelt afstande, vinkler og dihedraler. Automatisk oprettelse af Linear Least Motion (LLM)-stier 2D- og 3D-beregning og visning af: Molekylær orbitaler (AO'er, MO'er eller LMO'er) Total elektrondensitet Densitetsforskelle Molecular Electrostatic Potentials (MEPMaps) Grundlæggende inputfilgenerator til GAMESS OpenGL kvalitet 3D-gengivelse Understøttelse af molekylær symmetri Generer symmetriafhængige atomer Bestem symmetri unikke atomer Bestem automatisk listen over understøttede punktgrupper for et sæt koordinater. Roter koordinater til den korrekte principorientering Vis symmetrioperatorer for mange punktgrupper Udskriftskvalitetsoutput (farve eller sort/hvid) via direkte udskrivning eller Kopier og Sæt ind i en anden applikation. Output i en række forskellige former, herunder Windows bitmap, JPEG, PNG, CML, XMol XYZ, MDL molfile, POV-Ray, Flash Movies og QuickTime-film.