Partition

Beskrivelse

Partition er en modelbaseret statistisk softwarepakke til identifikation af populationsunderdeling (barrierer for genflow) og tildeling af individer til populationer på basis af deres genotyper ved co-dominante markør loci. Egnede genetiske markører indbefatter mikrosatellitter og allozymer. Ikke-forbundne eller løst forbundne markør-loci bør anvendes, således at antagelsen om koblingsligevægt er rimelig.

Den underliggende populationsgenetiske model er passende til udkrydsning af diploide organismer. Det antages, at individerne i stikprøven tilhører en række separate kildepopulationer. Disse kildepopulationer antages at være ved Hardy-Weinberg og koblingsligevægt, men den alleliske sammensætning af disse kildepopulationer, og endda antallet af kildepopulationer repræsenteret i prøven, behandles som parametre, hvis værdier er ukendte.