Pedimap

Beskrivelse

Pedimap er et værktøj til at udforske og visualisere strømmen af ​​fænotyper og alleler (observeret eller baseret på Identity-by-Descent-beregninger) gennem stamtavler. Den har værktøjer til manuel og automatisk udvælgelse af dele af stamtavlen baseret på kriterier såsom forfædre og/eller afkom til et specificeret antal generationer, langs moder-, fader- eller begge linjer, søskende osv. For hvert valg kan der være flere visninger genereret for at vise forskellige koblingsgrupper, fænotypiske træk osv. Når en visning er oprettet for en markering, kan den automatisk genskabes for enhver anden markering. Pedimap kan håndtere numeriske såvel som tekstuelle fænotypiske scores og med polyploider såvel som diploider. Den genetiske information kan vises i henhold til genetiske koblingskort, deraf navnet.