Ascalaph Designer

Beskrivelse

Ascalaph Designer er et generelt program til molekylær dynamiske simuleringer. Under et enkelt grafisk miljø er repræsenteret som deres egen implementering af molekylær dynamik samt metoderne til klassisk og kvantemekanik af populære programmer. Funktionerne omfatter molekylær grafik: flere vinduer, to kameraer pr. model, CPK, Wire frame, Stick, Ball and Stick og CPK Wire frame stilarter, molekylær modelbygning: krystalbygger, kædebygger, tegning med mus, molekylær geometri redigering, foreløbig optimering , kvanteoptimering og fjernelse af sammenstød, optimering af molekylær geometri med konjugerede gradientmetoder, molekylær dynamik: multipel tidstrinsintegration, fjerde ordens integration, supercomputerberegninger ved hjælp af MDynaMix, fleksibel SPC-vandmodel og implicit vandmodel og kvantekemi med hjælp af CP2K og PC GAMESS/Firefly: energi, molekylær geometrioptimering og potentielle afledte ladninger.