MD simulation for iPhone

Beskrivelse

University of Ulsan, School of Mechanical Engineering, MNTF (Micro/Nano-scale Thermo-Fluids Engineering) Lab. http://home2.ulsan.ac.kr/user/nanofluid/Følg venligst tutorials nedenfor for nogle eksempler. Alle eksempler nedenfor antager starttilstandene efter indlæsningsskærmen. (juster Dt for at se resultatet hurtigere. Prøv også dem med [WCA] og [Ideal]) 1. Couette flow simulering [Start] -vent indtil systemet når til ligevægten- [Couette] - vent indtil systemet når til stabil tilstand (Øjeblikkelige hastighedsprofiler tilgængelige i den grå boks nederst til højre) 2. Poiseuille flow simulering [Start] - vent indtil systemet når ligevægten - [Poiseuille] - vent indtil systemet når stabil tilstand 3. Diffusion simulering [Init3,4,5] - indstil måltemperatur omkring 250~350K - [start] 4. Frysning & krystallisation simulering [Init3,4,5] - sæt måltemperatur lavere end 80K - [start] 5. Flere tips! [Start]-knappen indstiller Maxwell-Boltzmann-hastighedsfordelinger til alle væskemolekyler. ! [L-J] er for VDW-potentiale baseret på Argons molekylære parameter, [WCA] er rent frastødende intermolekylær interaktion og [Ideal] negligerer molekylernes størrelse og kollisioner, som den ideelle gaslov antager. ! Du kan øge tidstrinnet (Dt) for at gøre simuleringerne hurtigere, men det kan forårsage sammenbrud af simuleringer og nulstille. ! Når simuleringen nulstilles, indstilles måltemperatur og tidstrin (Dt) til den lavest mulige værdi. ! Du kan ændre måltemperaturen under simuleringerne og justere den aktuelle temperatur ved hjælp af termostat. ! Du kan starte simuleringer i forskellige begyndelsesforhold ved at bruge [Init]-knappen! [T/Tt]-knappen indstiller termostaten til systemet med måltemperaturen. "RED" tag betyder hastighedsskaleringstermostat og "ORANGE" tag betyder Nose-Hoover termostat. ***Molekylær dynamik i iPhone-argonvæske i 5nm-kanal I de sidste to årtier har den revolutionerende fremgang inden for højtydende computerressourcer ført til Molecular Dynamics (MD)-studierne af atomistisk niveaumodellering i personlige stationære computere. Nu udvider jeg MD-platforme til de tilgængelige kraftfulde mobile computerenheder (iPhone), og dette kan være det første forsøg i MD-historien. Væskestrømme i mikron- og nanoskala-domæner ses ofte i komponenterne i mikroelektromekaniske systemer, mikrofluidiske enheder og i computerharddiske. For eksempel, for harddisksystemerne, er afstanden mellem hovedet og mediet i størrelsesordenen titusinder af nanometer. Væskestrøm i så små skalaer kan ikke beskrives ved hjælp af kontinuumhypotesen. Molekylær dynamik kan potentielt adressere disse problemer såsom fast-væske-grænseflader/interaktioner, der opstår i nanoskala-regimet. Ydermere kan simuleringer i stor skala baseret på atomistiske modeller også adressere overgangen fra atomistisk til kontinuumskalatilgang. Dette er en molekylær dynamik (MD)-kode (i2DMD), der kører på iPhone. Denne kode har de fleste funktioner (men forenklet til visualisering og uddannelsesformål) af den faktiske MD-kode, der bruges til mine publikationer i SCI-tidsskrifter, der er angivet i informationslinket. Du kan simulere Couette flow, Poiseuille flow, diffusion og frysning af argon i 5nm kanal med periodiske randbetingelser. Jeg håber, at denne prøvekode ville hjælpe folk til at forstå molekylet på nanoskalaen