RightField

Beskrivelse

RightField kan angive en række tilladte termer fra en valgt ontologi (underklasser, individer eller kombinationer) for hvert annotationsfelt. Det resulterende regneark præsenterer disse termer for brugerne som en simpel rulleliste. Dette reducerer adoptionsbarrieren for brug af community-ontologier, da annoteringen er lavet af den videnskabsmand, der genererede dataene, i stedet for en tredjepart, og annoteringen indsamles på tidspunktet for dataindsamlingen.

RightField er en selvstændig Java-applikation, som bruger Apache-POI til at interagere med Microsoft-dokumenter. Det gør det muligt for brugere at importere Excel-regneark eller generere nye fra bunden. Ontologier kan enten importeres fra deres lokale filsystemer eller fra BioPortals ontologidepot. Individuelle celler eller hele kolonner eller rækker kan markeres med de påkrævede områder af ontologitermer, og et individuelt regneark kan annoteres med termer fra flere ontologier.

Når det er markeret og gemt, indeholder det RightField-aktiverede regneark 'skjulte' ark med information om oprindelsen og versionerne af ontologier, der er brugt i annoteringen. Denne herkomstinformation er vigtig i tilfælde af fremtidige ontologiændringer, som kan forælde allerede valgte værdier, eller som kan tilføje flere finkornede muligheder og bede om genkommentarer. RightField er tænkt som et administratorværktøj. Det udvider regneark, der måske allerede er i overensstemmelse med specifikke skabeloner for yderligere at standardisere terminologien.