| Version | 1.1.5 |
|---|---|
| Forlægger | MultiGeneBlast |
| Udgivelses dato | 3. apr. 2013 |
| Dato tilføjet | 4. apr. 2013 |
| Os krav | Windows 2003, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Krav | None |
| Samlet antal downloads | 95 |
| Pris | Free |
Beskrivelse
MultiGeneBlast er et open source-værktøj baseret på en omformatering af FASTA-headerne af NCBI GenBank-proteinindgange, hvorved det kan spore deres kildenukleotid og koordinater. MultiGeneBlast kan hjælpe med påvisningen af sådanne multigendele til syntetiske biologiprojekter. Et syntetisk bibliotek af operoner kan oprettes baseret på dets output for at identificere de operoner, hvis funktion er tættest på den, som brugeren ønsker. Dette værktøj giver mulighed for at identificere alle homologe genomiske regioner ved at kombinere resultaterne af enkelte BlastP-kørsler på hvert gen og sortere genomiske regioner fra enhver GenBank-indgang efter antallet af hits, synteny-konservering og kumulativ Blast-bit-score. Arkitektursøgninger kan udføres for at finde alle genomiske regioner med Blast-hits til enhver brugerspecificeret kombination af aminosyresekvenser.
