| Version | 1.01 |
|---|---|
| Forlægger | Paul A. Wilson |
| Udgivelses dato | 25. aug. 2008 |
| Dato tilføjet | 11. aug. 2004 |
| Os krav | Macintosh, Mac OS X 10.3 |
| Krav | Mac OS X 10.3 |
| Samlet antal downloads | 29 |
| Pris | Free |
Beskrivelse
Kommandolinjeværktøj til sammenligning af kommaseparerede datafiler ved hjælp af relative forskelle for at bestemme de mest ens konformationer. Compsort sammenligner datafilerne ved hjælp af relativ forskel, beregner en lighedsscore, sorterer scorerne i stigende rækkefølge (lavere værdier repræsenterer større lighed), gemmer X antal lave scores.
Datafilerne produceret af brugeren skal være kommaseparerede tekstfiler. Hver fil repræsenterer et unikt molekyle. Hver række i en fil repræsenterer en unik konformation af molekylet. Den første kolonne i datafilen skal være en etiket, der er unik for konformationen repræsenteret af rækken. Resten af kolonnerne er numeriske deskriptorer, såsom afstandsmålinger.
Rækkerne sammenlignes kombinatorisk mellem filer. Etiketterne i sammenligning er sammenkædet og gemt med scorerne for rækkesættet. Dette giver en måde at identificere de konformationer, der producerede en given lighedsscore.
Fremtidigt arbejde omfatter:
tilføjelse af GUI-grænseflade
udstationering papir på min 3D farmakofor modellering algoritme
En parallel version med MPI
