CodonCode Aligner

Beskrivelse

CodonCode Aligner er brugervenlig software til DNA-sekvenssamling, justering, contig-redigering og mutationsdetektion. Aligner er kompatibel med Phred-Phrap og understøtter fuldt ud sekvenskvalitetsresultater, samtidig med at den tilbyder en velkendt brugergrænseflade, der er nem at lære. Funktioner omfatter import af sekvenser fra tekstfiler, align contigs til hinanden, mens linkene til sporene holdes, find heterozygote mutationer, definer områder af interesse ("features"), import og rediger Phrap-genererede samlinger, eksporter sekvenser og funktioner, import sekvenser fra ABI- og SCF-filer, vektortrim, align til en referencesekvens, analyser heterozygote indsættelser og sletninger, naviger mellem brugerdefinerede funktioner og eksporter Consed-kompatible montageprojekter.